就在那石宝一路杀出了杭州城，奔向燕地而去之时，这杭州城也是终于被宋军给攻夺而下，其城中大将南安王方天定也是被韩世忠所擒，囚于军中。这时在那城中南安王府内，种师中与刘延庆等一众宋军将领尽皆汇聚于此并大摆宴席庆祝今夜之功。
在这宴席之上，种师中则是大大夸奖了韩世忠等人的勇武和其谋略，使得其能够如此之快的便是将这杭州重城给攻夺了下来。韩世忠等人听得主帅夸奖，也都是十分欢喜。之后其便是拜道“主帅，依末将之见，如今我等应该在方腊尚未知晓此杭州失陷之时，再兵马，前往下一关卡。”
种师中听后则是说道“韩将军啊，虽然你说的有理，可是我军于今夜刚刚经历了两场大战，已然有所劳累，是以我军要在此杭州城内休养上一些时日才可啊。”韩世忠听后则是说道“可是，若我军不趁此时机乘胜追击的话，恐怕日后再想前进，就会有极大的阻碍了。”
种师中则是说道“韩将军，某知道你所言之意，可是要想成就大事，就必须顾全大局。虽然你所谋之策有极大的可能取得胜利，可是我军已经是疲惫之军了，暂时不宜在动干戈，这是为了能够更大的保全将士们的性命所做的决定，你可明白？”
韩世忠听得此道理后，则是拱手拜道“是，世忠受教了。”随后，韩世忠便只得听从种师中的命令，暂时在这杭州城中停留下来。而此时，那在老巢清溪源洞得知宋廷大军竟然都已经把杭州给攻陷了，而且自己的太子也是未曾逃脱后，大怒不已，随即便是点起大军亲自领军要前来与宋军决一死战。
方腊率大军亲征，所带人员有皇侄方杰，骠骑上将军杜微，还有那镇守昱岭关的神射手庞万春。其此行共领军十万，可谓是倾巢而出，来至杭州城下要与宋军决一死战。其实方腊是被这些接二连三的不利消息给刺激到了，竟主动舍弃了那些难攻关隘，前来与宋军决战。
或许是在方腊心中，宋军还应该是之前他刚起事之时的那般软弱不堪的样子，所以其在听得己方大军接二连三的惨败之后才会这般坐不住。可就是因为他这一时脑热所下的决定，导致他不但断送掉了自己的大势，而且还断送掉了自己的性命。
只见方腊领起大军在这杭州城下摆开阵势前来叫战，那种师中在城中见到方腊竟然亲临之后大喜不已，随后便是命令开门出城，迎战南军。此两军交战之前，也是如同往常那般要先斗将，方腊这便派出了皇侄方杰，一杆方天画戟在手，无人能敌。
而宋军那边则是派出了一直取得大功的韩世忠前来与之匹敌，二人随即便是交起手来，可那韩世忠又如何是这方杰的对手，只与其缠斗了十数回合便被其击败，只得含恨而退。方杰见韩世忠要走，自然不肯放，于是便是策马来追。
而这时在那宋军阵中则是有着呼延通与吴阶两将飞马来救韩世忠，韩世忠见有兄弟相救之后便也不再逃亡，转而回过头去斗那方杰。此时方杰舞着那杆方天画戟迎战韩世忠，呼延通与吴阶三人，颇有一番当年虎牢关前温侯斗三英的风采。
可这方杰并不是吕布，最终还是难敌此三人之手，被其击败不说，而且还在三人联手合击之下取走了性命。那方腊在后方本阵内见方杰也是命陨沙场之后则是大怒不已，连忙下令大军即可动进攻，要不惜一切代价，击溃宋军，夺回杭州城。
面对方腊这破釜沉舟的气势，种师中则是怡然不惧，随即便是命大军上前迎战南军，两军就此展开了激烈的拼杀。可南军虽然勇猛，却也不及此支先后征战过西夏，王庆，如今又是方腊的百战之军，不多时便是显露了败绩，渐渐不敌宋军。
见此情景后，那庞万春与杜微都是前来请求方腊赶紧退军，并且移驾返回清溪洞。可这方腊则就如同钻进了牛角尖了一样，死活都不肯退军，而且也不肯离开，反而还命令庞万春与杜微两人一同上前迎战宋军。杜微与庞万春两人无奈，只得听其命令，向前拼杀而已。
不过此时方腊大军败势已定，任此二人有再大的能耐，也是无济于事。最终，两人双双力竭战死，而那方腊本人也是为宋军所擒获。此时方腊被擒，南国叛军没有了领导，则陷入了一片慌乱之中。
后种师中则是命令韩世忠与刘光世等人立刻点起兵马向其他地方杀去，随即其两支大军所到之处，城中守将具都开门投降。毕竟此时方腊家的人都已经不在了，其又为何还要再为其效力呢，还不如趁早降了，或许还可保留一命。
而事实证明，其此选择是是分正确的，韩世忠刘光世等人见其开城投降之后开心不已，随即便是免了这些守城将士们的死罪，只将其兵力没收，并且又还了他们百姓的身份。至此，江南方腊这一大寇也是被宋军所剿灭，种师中等人押着方腊与方天定两人一同向汴京城返还而去。
之后种师中大军凯旋而归，徽宗皇帝听从太尉宿元景的话，亲自出城相迎。其此举也是使得这些为其征战的将士们心中流过一股暖流，种师中与刘延庆等将则都一同跪拜天子，三呼万岁。徽宗见后也是大喜，赶忙令其起身，再与其一同返回皇宫，详述剿匪经过，同时又将那方腊两人押到了天牢中去。
之后，在大殿之上，徽宗在种师中等人详细述说了剿匪经过之后，对此战有功之士大为奖赏，君臣同乐