玄武门的局势稳定之后，李世民派尉迟敬德前往太液池面见李渊。
尉迟敬德身穿重甲，手持长矛，走到太液池边上。
李渊见他身上的血迹未干，惊愕不已，问道：“今日是谁在作乱，你来这里做什么？”
尉迟敬德回答说：“秦王因为太子、齐王作乱，举兵诛灭他们，恐怕惊动了陛下，就派臣来宿卫陛下。”
李渊对裴寂说道：“没想到今天发生了这种事情，如何处置？”
萧瑀、陈叔达说：“建成、元吉本来就没有参与晋阳首谋，又没有大功于天下，他们嫉妒秦王功高望众，蓄谋予以加害。如今他们已被秦王诛杀，秦王功盖天下，万民归心，陛下此时封他为太子，委以国事，应该就不会再发生什么事了。”
李渊叹了一口气，说：“事已至此，也只能这样了。”
此时，太子和齐王的余党尚在各自的府中，他们还不知道宫中发生的事情。尉迟敬德请求李渊降下手敕，命令大唐所有兵马全部受秦王节制。
李渊于是让宇文士及拿着手敕向众人宣布，又命令黄门侍郎裴矩到东宫告知驻守的将卒，太子、齐王的余党得知情况，全部散去。
李渊这才召来秦王，对他说：“父皇因建成是嫡长子，遵循国家礼制立他为太子，也是不得已的事。没想到他们屡次加害于你，真是委屈你了。”
李世民于是跪服在父皇李渊的胸前，大哭不止。
此时，秦王府兵马已经急速前往齐王府和东宫，他们各自都还有五个儿子。
秦王心腹侯君集派人前来请示，对建成和齐王的子嗣如何处置。
李世民原本不想扩大事态，但长孙无忌在一边说道：“斩草不除根，春分吹又生！”
李世民遂下定决心，将太子、齐王的十个儿子全部杀尽，彻底断绝了他们的血脉。
诸将见势，想要杀尽太子、齐王左右，没收他们的家财。尉迟敬德极力劝阻说：“罪在两个元凶，他们既然已经身死，不可再波及余党。秦王殿下想要天下安定，你们不可再枉杀无辜。”
为了安定人心，李渊又特地下诏说：“凶逆之罪，只在建成、元吉二人，其余余党，不再追问。”为此，李渊又大赦天下。
三天后，李渊立秦王做太子。并下诏——自此以后，军国事务，无论大小全部交由太子处理，然后上奏。
紧接着，天策府被罢除。
两个月后，李渊传位给李世民，李世民在东宫显德殿登皇帝位。旧日天策府的僚属基本上撑起了朝廷中枢的架构。
为了稳定朝局，李世民特意赦免了前太子冼马魏征、前太子中允王珪、前太子右卫率韦挺、翊卫车骑将军冯立等人，迅速安定了李建成的余党。
平心而论，李建成绝非平庸之辈，他身边的辅臣大多都是冶世的栋梁之才。
不过，李世民天生英武难自弃。他也是别无选择，不是夺嫡，就是死亡。他发动了一场突如其来的政变，使得一切原有的格局被迅速打破。
天下还是要以稳定为先，李建成在太子位将近十年时间，他的党羽遍布天下。李世民想要安定天下，必须要对这些人做出合理的安排。
李渊身后的一批老臣，除了极少数还在任上，绝大部分随他一起退休，颐养天年。
李渊当起了太上皇，整日在太极宫中饮酒作乐，不时弹弄他心爱的琵琶。只是，他不再有往日的快乐。
做为慈父的李渊，他也深感无奈，自己的儿孙只剩下秦王一脉，除了传位，他已没有更好的选择。
李世民初登帝位，大赦天下。他改元贞观，誓要涤清天下，给天下万民一个富足、强盛、安乐的大唐盛世。