临安降城之后，刘云派遣梁萧北上，去率领一部分久经战阵的“山寨部队”南下支援，准备组织最后的抵抗，而梁萧在山东崂山遇到了跟随吴常青学医的青梅竹马花晓霜，后来遇到了贺陀罗等敌人，与原著中的剧情差不多，但此时梁萧的武功已经和贺陀罗不相上下，贺陀罗等人奈何不了梁萧，也杀不了吴常青，只好退走。最后，花晓霜还是跟随梁萧南下，梁萧这小子偷奸耍滑，让大部队走海路，他和花晓霜两人走陆路，拖拖拉拉，一路上尽是卿卿我我，把公事都忘在一边（其实还是完成了任务，刘云交给他的任务很简单，只是将部分部队带出来带到船上就行，至于今后的行动却没有要求）。于是，梁萧和花晓霜两人和原著一样在安徽九华山的天香山庄遇到柳莺莺，然后发生了一系列的事件。
这些闲事，刘云都管不着，他只是率领军民一路南撤，一边抵抗，一边招收那些愿意保家卫国的青壮，在良好的装备底下，这些青壮经过与蒙古人的作战，逐渐成长为一支合格的军队。
1277年，元军进攻两湖，守将吕德抵挡不住，退往广东，此时元军趁机沿长江西进，准备入蜀，不料却被刘云在重庆部署的一万步枪兵阻挡，元军进攻受挫，损失惨重，只好退兵，把兵力集中在江南，准备全力剿灭流亡的南宋小朝廷。从1277年起，元军猛烈进攻，南宋小朝廷辗转流离，数次迁移，终于撤出福建，退往广东。此时，南方的江西有文天祥召集的十数万义军，但文天祥不是武将，对军事并不熟练，这些匆匆召集的义军战斗力不强，而广东才是重兵聚集之所在。广东有吕德所部五万余人，张世杰也率领三万多将士撤出福建，护送小朝廷来到广东，其实最强的军力应当是刘云的军队，他前前后后救下无数大宋败兵，之后收编了他们，同时又招收了许多百姓参军，此时训练已毕，再加上1276年之前就带出来的精锐，总计竟然有四十万大军，全部装备了精良的护甲和武器，其中还有三百多门红夷炮！嗯，这个火炮为什么又能用了呢？其实红夷炮的技术跟宋朝的原始火炮相比并不先进太多，所以是允许使用的，而之前刘云用过的远程加榴炮是八百年后的技术，自然不能用。
文天祥在江西孤军奋战，而宋朝精锐并不在此，所以文天祥打得很辛苦。刘云有派人过去建议文天祥南下休整，但随后宋廷就给文天祥下了命令，要他“北上”，这简直是以卵击石嘛，朝廷怎能下这样的命令？刘云派人生，对朝廷的命令坚定不渝地执行，刘云无奈，只好派人送了一批粮草装备过去支援。
现在刘云将大军驻扎在广州附近，广州现在有四十万人在防守，城墙已经重建过了，新城的规模比旧时长安城还要大一倍，而且放置了两百多门红夷炮，就算元人有百万大军也不可能攻下。而广州东边的东莞，刘云干脆让人腾出道来，虽然小朝廷就在那边，但刘云根本不派兵，朝廷怎样下令都不派兵，因为那里就是崖山，剧情的发生地点，因为有系统在，刘云不能轻举妄动。
时光如水，两年时间很快就过去了，现在已是1279年，文天祥败于元军，退往广东，而元军也攻到崖山附近，陆军五十多万，仍由伯颜和阿术统领，水军有十多万，由张弘正统领，从海上攻击宋朝水军，南宋小朝廷危在旦夕。
此时，刘云忽然感觉到系统能量一阵波动，忽然大喜道：“时间快到了！系统的限制时间马上就要到了！终于要解开限制，我的部队终于可以出现了！”听到这个消息，梅青此时也是相当高兴，笑道：“那敢情好，这几年来我们钻研了这么久，连多核cpu都做出来了，火控系统早就用电脑控制，现在终于可以试一下新武器系统的威力了！”
于是，刘云便开始把正在台海附近的中华舰队调过来。此时，经过刘云和梅青三年的努力，他们已经把集成电路给做出来了，并且根据资料不断改进工艺，从以前的几微米到现在的二三十纳米，现在已经把“现代”cpu造了出来，而且已经接近半导体集成电路的极限了。半年前，当他们成功造出二十纳米光刻设备，并生产第一批二十纳米工艺的半导体芯片之时，刘云忽然泪流满面地道：“老天啊，我们终于造出中国欠缺的半导体制造设备了，就算我们现在就回到地球，我们也能对国家有贡献了。”刘云所说的是他离开地球被抓来这里之时，中国设计的cpu却要交给别人来代工，而国内的光刻设备还停留在国外十年前的水平，或许没有十年的差距，但七八年总是有的，这可真是一个悲哀。半导体产业是追不上国外的了，或许国内已经有团队在研究下一代的计算机，试图在新阶段追赶上世界先进水平，但目前全世界都没有什么进展，所以这个目标还有些遥远。09年10月，中国确实有制造出世界第二的超级计算机，虽然超级计算机的互联技术是原创的，但最基础的cpu却是英特尔的。
刘云说“如果现在回去，也能对国家有贡献”，此时他忽略了一个问题，如果他现在回去，那么现在回到地球，那地球是什么年代了？其实现在时空战场和地球尚未发生关联，所以刘云他们是可以回到他们被抓来的那一刻之后的，当然这需要一些大神通，现在还做不到。
刘云下命令之后，一百多艘大型军舰就向广东方向全速驶来，现在光是中华舰队就有了38艘