石英联盟01.神奇宝贝，就决定是你了！（小智、小茂登场，小智得到皮卡丘并看到凤王）
02.神奇宝贝中心大对决（小霞加入，火箭队登场）
03.收服神奇宝贝！（小智收服绿毛虫并进化成铁甲蛹，收服比比鸟）
04.武士少年的挑战（小智的铁甲蛹进化成巴大蝴）
05.皮卡丘的决斗！（小刚加入，小智得到灰色徽章）
06.很多皮皮在这里（小刚收服超音蝠）
07.华蓝市的水中花（小智得到蓝色徽章）
08.通向神奇宝贝的擂台之路09.神奇宝贝必胜指南10.神奇宝贝乡的妙蛙种子（小智收服妙蛙种子）
11.走失的小火龙（小智得到小火龙）
12.杰尼龟军团（小智收服杰尼龟）
13.正辉的灯塔（小智收服大钳蟹）
14.电击对决，枯叶道馆（小智得到橙色徽章）
15.圣安奴号之战16.神奇宝贝漂流记！
17.巨大神奇宝贝之岛18.蓝普卢奇的度假日19.玛瑙水母、毒刺水母（小霞收服墨海马）
20.幽灵神奇宝贝和夏天庙会21.巴大蝴再见（小智的巴大蝴离队）
22.凯西，超能力大决斗23.在神奇宝贝塔收服幽灵24.鬼斯通对抗超能力（小智得到黄金徽章）
25.火爆猴，别生气哦！（小智收服火爆猴）
26.艾莉嘉和臭臭花（小智得到彩虹徽章）
27.索利柏与神奇宝贝催眠（小霞得到可达鸭）
28.美容街，饲育家大决斗（小刚得六尾）
29.格斗神奇宝贝大决斗（小智的火爆猴离队）
30.小磁怪的电气老鼠之梦（小智收服臭臭泥）
31.好多地鼠（武藏的阿柏蛇进化成阿柏怪，小次郎的瓦斯弹进化成双弹瓦斯）
32.浅红道馆的忍者决斗（小智得到粉红徽章）
33.火焰的神奇宝贝大赛跑34.袋龙的摇篮曲35.迷你龙的传说（小智收服肯泰罗）
36.暴风雨的单车路37.百变怪跟模仿少女38.皮卡丘的森林（原本是电脑战士3d龙）
39.伊布四兄弟40.醒来吧！卡比兽！
41.神奇宝贝道馆的决斗42.椰蛋树军团大前进（小智的小火龙进化成火恐龙）
43.派拉斯跟派拉斯特44.胖丁唱歌吧45.复活？化石神奇宝贝（小智的火恐龙进化成喷火龙，得到蛋）
46.吉利蛋的病历簿47.卡蒂狗跟小次郎48.大葱鸭的鸭49.波克比是谁的呢（蛋孵化成波可比，小霞得到）
50.妙蛙种子的不思议花园（小智的妙蛙种子学会阳光烈焰）
51.激斗！神奇宝贝娃娃节（武藏收服大舌头）
52.儿童节全员大集合53.警犬卡蒂狗54.按快门的机会是皮卡丘55.神奇宝贝鉴定考56.抚养家的秘密（亚马多、小三郎登场）
57.燃烧吧！红莲道馆58.决战红莲道馆（小智得到深红徽章）
59.水箭龟之岛60.华蓝道馆，水中战斗（小霞把墨海马和宝石海星存在道馆）
61.皮皮对抗胖丁62.常磐道馆，最后的徽章（小智得到绿色徽章）
63.神奇宝贝马戏团的吸盘魔偶（小智的妈妈得到吸盘魔偶）
64.迷唇姐的圣诞节65.用大岩蛇露营66.宿敌大决斗，大木研究所67.当呆呆兽变成呆河马的时候68.踏浪皮卡丘的传说69.植物园的臭臭花70.神奇宝贝电影71.喵喵之歌72.四天王希巴登场73.激烈冲突超古代神奇宝贝74.嘎啦嘎啦的骨头棒75.开火！神奇宝贝联盟开幕式76.神奇宝贝联盟开幕！水之场地（小智的大钳蟹归队并进化成巨钳蟹）
77.冰之场地火炎之战78.草之场地意外的强敌79.劲敌登场（阿弘登场）
80.石英运动场vs阿弘（小智止步石英大会前16强）
81.神奇宝贝联盟最后战斗
橘子联盟~城都联盟82.真新镇，新的开始（小智的比比鸟进化成比雕，本集结束后离队）
83.飞行船是不幸船84.南国神奇宝贝与gs球（小刚离队）
85.拯救乘龙（小建加入，小智得到乘龙）
86.橘子联盟？夏干道馆（小智得到樱花徽章）
87.消失的神奇宝贝之谜88.水晶大岩蛇89.粉红神奇宝贝之岛90.化石盔化石的秘密91.跳吧！神奇宝贝豪华油轮92.再见可达鸭，又来哥达鸭93.航海的乔伊，破浪前进吧94.奈普鲁道馆，雪山之战（小智得到白浪徽章）
95.大胃王卡比兽，大恐慌（小智收服卡比兽）
96.幽灵船跟幽灵神奇宝贝97.喵喵之岛98.飞天螳螂，战士的尊严（小建收服飞天螳螂）
99.南方之岛，全员大集合100.四天王科拿，冰之战斗101.尼多朗的恋爱故事102.大平原的小磁怪103.地下道的怪物104.柚子道馆类型格斗三比三（小智的杰尼龟学会水炮，小智得到轮宝徽章）
105.皮卡丘对抗喵喵106.喷火龙，就决定是你了！
107.灭火大战，杰尼龟对抗卡咪龟108.燃烧吧！卡比兽！
109.接棒决斗！最后的道馆！（小智得到琉璃徽章）
110.鲤鱼王进化的秘密111.蚊香蝌蚪和小霞（小霞得到蚊香蝌蚪）
112.胜利者杯，全员大对决113.最后战斗，快龙登场（小智得到橘子联盟胜利者杯）
114.再见了乘龙（小智的乘龙离队）
115.顽皮蛋大爆炸116.真新镇，我回来了（小刚加入，小建离队）
117.宿敌对决，小智对抗小茂城都联盟118.若叶镇，吹起开始之风的城镇！
119.投手的菊草叶120.赫拉克罗